（参）2018.12.10管理職の出退勤データ、保存の義務はあるか リーガルブレイン社会保険労務士法人

なお、労基法上の規定とは別に、『働き方改革推進法』では、労働安全衛生法（安衛法）改正により、健康管理の前提として『すべての労働者（管理職を含む）の労働時間の把握義務』を課しています（労働安全衛生規則52条の７の３第２項）。
そしてその労働時間の記録は、３年の保存が義務づけられています（安衛法66条の８の３、平成31年４月１日施行予定）ので、こちらについても注意が必要です。 

引用元
管理職の出退勤データ、保存の義務はあるか